Analyse de l’épidémie de COVID-19 en France et scénarios de contrôle
Samuel Alizon
,
Mircea T Sofonea
[Rapport de recherche] 9, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Les effets sexe spécifiques de COVID-19 en France et l’implication potentielle des déficits en G6PD
Yannis Michalakis
,
Mircea T Sofonea
,
Samuel Alizon
[Rapport de recherche] 11, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
hal-02950702v1
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Coevolution of virulence and immunosuppression in multiple infections
Tsukushi Kamiya
,
Nicole Mideo
,
Samuel Alizon
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Vertical transmission in Caenorhabditis nematodes of RNA molecules encoding a viral RNA-dependent RNA polymerase
Aurélien Richaud
,
Lise L. Frezal
,
Stephen Tahan
,
Hongbing Jiang
,
Joshua Blatter
,
et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , 2019, 116 (49), pp.24738-24747.
⟨10.1073/pnas.1903903116⟩
Article dans une revue
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Patterns and ecological drivers of ocean viral communities
Jennifer Brum
,
J Cesar Ignacio-Espinoza
,
Simon Roux
,
Guilhem Doulcier
,
Silvia G. Acinas
,
et al.
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Repurposing the Hybrid Capture 2 (HC2) screening test for whole-genome sequencing of human papillomaviruses
A. Debernardi
,
W. Jarassier
,
C. Soret
,
C. Mougin
,
Samuel Alizon
,
et al.
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Early assessment of diffusion and possible expansion of SARS-CoV-2 Lineage 20I/501Y.V1 (B.1.1.7, variant of concern 202012/01) in France, January to March 2021
Alexandre Gaymard
,
Paolo Bosetti
,
Adeline Feri
,
Gregory Destras
,
Vincent Enouf
,
et al.
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Two waves and a high tide: the COVID-19 epidemic in France
Mircea T Sofonea
,
Corentin Boennec
,
Yannis Michalakis
,
Samuel Alizon
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Phylodynamique
Samuel Alizon
Chapitre d'ouvrage
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Inexpensive Research in the Golden Open-Access Era
Samuel Alizon
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Anticipating COVID-19 intensive care unit capacity strain: A look back at epidemiological projections in France
Mircea T Sofonea
,
Samuel Alizon
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SARS-CoV-2 viral RNA levels are not 'viral load
Yannis Michalakis
,
Mircea T Sofonea
,
Samuel Alizon
,
Ignacio G. Bravo
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Can we eradicate viral pathogens?
Samuel Alizon
,
Paul E Turner
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De Delta à Omicron, scénarios de tendances hospitalières pour l'hiver 2021-2022
Samuel Alizon
,
Mircea T Sofonea
[Rapport de recherche] 16, CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique; IRD - Institut de recherche pour le developpement; Université de Montpellier. 2021
Rapport
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Tracing the origins of SARS-CoV-2 in coronavirus phylogenies
Erwan Sallard
,
José Halloy
,
Didier Casane
,
Etienne Decroly
,
Jacques van Helden
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Memory is key in capturing COVID-19 epidemiological dynamics
Mircea T Sofonea
,
Bastien Reyné
,
Baptiste Elie
,
Ramsès Djidjou-Demasse
,
Christian Selinger
,
et al.
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Phage production is blocked in the adherent-invasive Escherichia coli LF82 upon macrophage infection
Pauline Misson
,
Emma Bruder
,
Jeffrey Cornuault
,
Marianne de Paepe
,
Pierre Nicolas
,
et al.
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Emerging resistance mutations in PI-naive patients failing an atazanavir-based regimen (ANRS multicentre observational study)
L Lambert-Niclot
,
C Grude
,
L. Chaix
,
L Charpentier
,
C Reigadas
,
et al.
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Dynamic nanopore long-read sequencing analysis of HIV-1 splicing events during the early steps of infection
Nguyen-Quang Nam
,
Sophie Goudey
,
Emmanuel Segeral
,
Ammara Mohammad
,
Sophie Lemoine
,
et al.
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Epithelial stratification shapes infection dynamics
Carmen Lia Murall
,
Robert Jackson
,
Ingeborg Zehbe
,
Nathalie Boulle
,
Michel Segondy
,
et al.
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hal-02069914v1
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SARS-CoV-2 viral dynamics in infections with variants of concern in the French community
Gina Cosentino
,
Mathieu Bernard
,
Joëvin Ambroise
,
Jean-Marc Giannoli
,
Jérémie Guedj
,
et al.
2021
Pré-publication, Document de travail
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Limites et délais dans l’estimation du nombre de reproduction
Samuel Alizon
,
Bastien Reyné
,
Mircea T Sofonea
[Rapport de recherche] 5, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Influenza virus protein PB1-F2 interacts with CALCOCO2 (NDP52) to modulate innate immune response
Olivier Leymarie
,
Léa Meyer
,
Lionel Tafforeau
,
Vincent Lotteau
,
Bruno da Costa
,
et al.
Article dans une revue
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The dynamic interplay of bacteriophage, bacteria and the mammalian host during phage therapy
Jacopo Marchi
,
Sophia Zborowsky
,
Laurent Debarbieux
,
Joshua S Weitz
Article dans une revue
pasteur-04158863v1
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Quantifying the relationship between SARS-CoV-2 viral load and infectiousness
Aurélien Marc
,
Marion Kerioui
,
Julie Bertrand
,
François Blanquart
,
Oriol Mitjà
,
et al.
Article dans une revue
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Emerging dynamics from high-resolution spatial numerical epidemics
Olivier Thomine
,
Samuel Alizon
,
Corentin Boennec
,
Marc Barthelemy
,
Mircea T Sofonea
Article dans une revue
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Analyzing and Modeling the Spread of SARS-CoV-2 Omicron Lineages BA.1 and BA.2, France, September 2021–February 2022
Mircea Sofonea
,
Bénédicte Roquebert
,
Vincent Foulongne
,
David Morquin
,
Laura Verdurme
,
et al.
Article dans une revue
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Évolution, écologie et pandémies
Samuel Alizon
Ouvrages
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Nosocomial transmission clusters and lineage diversity characterized by SARS-CoV-2 genomes from two large hospitals in Paris, France, in 2020
Valentin Leducq
,
Aude Jary
,
Antoine Bridier-Nahmias
,
Lena Daniel
,
Karen Zafilaza
,
et al.
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HPV cervical infections and serological status in vaccinated and unvaccinated women
Carmen Lia Murall
,
Bastien Reyné
,
Christian Selinger
,
Claire Bernat
,
Vanina Boué
,
et al.
Article dans une revue
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