Recherche - ENS - École normale supérieure Accéder directement au contenu

Filtrer vos résultats

87 Résultats
Domaines : sdv.bid.spt
Image document

One‐locus‐several‐primers: A strategy to improve the taxonomic and haplotypic coverage in diet metabarcoding studies

Emmanuel Corse , Christelle Tougard , Gaït Archambaud‐suard , Jean‐françois Agnèse , Françoise Messu Mandeng , et al.
Ecology and Evolution, 2019, 9 (8), pp.4603-4620. ⟨10.1002/ece3.5063⟩
Article dans une revue hal-02109732v1
Image document

Phylodynamique

Samuel Alizon
ISTE. Modèles et méthodes pour l’évolution biologique, , 2022, 9781789480696. ⟨10.51926/ISTE.9069.ch11⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02884408v1
Image document

ASAP: assemble species by automatic partitioning

Nicolas Puillandre , Sophie Brouillet , Guillaume Achaz
Molecular Ecology Resources, 2020, 21 (2), ⟨10.1111/1755-0998.13281⟩
Article dans une revue hal-03039819v1

Exploring congruent diversification histories with flexibility and parsimony

Jérémy Andréoletti , Helene Morlon
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04173637v1
Image document

Inexpensive Research in the Golden Open-Access Era

Samuel Alizon
Trends in Ecology and Evolution, 2018, 33 (5), pp.301 - 303. ⟨10.1016/j.tree.2018.02.005⟩
Article dans une revue hal-01788084v1
Image document

Phytoplankton Diversity and Community Composition along the Estuarine Gradient of a Temperate Macrotidal Ecosystem: Combined Morphological and Molecular Approaches

Pauline Bazin , Fabien Jouenne , Thomas Friedl , Anne-Flore Deton-Cabanillas , Bertrand Le Roy , et al.
PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e94110. ⟨10.1371/journal.pone.0094110⟩
Article dans une revue hal-02053813v1

Acute or Chronic? Within-host models with immune dynamics, infection outcome and parasite evolution

Samuel Alizon , Minus van Baalen
The American Naturalist, 2008, 172 (6), pp.E244-E256. ⟨10.1086/592404⟩
Article dans une revue hal-01567941v1

Evolutionary Constraints in Fitness Landscapes

Luca Ferretti , Daniel Weinreich , Fumio Tajima , Guillaume Achaz
Heredity, 2018, 121 (5), pp.466--481. ⟨10.1038/s41437-018-0110-1⟩
Article dans une revue hal-03868076v1
Image document

Can we eradicate viral pathogens?

Samuel Alizon , Paul E Turner
Journal of Evolutionary Biology, 2021, 34 (12), pp.1851-1854. ⟨10.1111/jeb.13958⟩
Article dans une revue hal-03500287v1

L'année polaire international au Muséum national d'Histoire naturelle

Juliette Arabi , Louis Deharveng , Alexandre A. Hassanin , Céline P Bonillo , Jean-Pierre Coutanceau , et al.
4e Journées Scientifiques du CNFRA, Oct 2007, Paris, France. ⟨10.13140/RG.2.2.28355.91689⟩
Communication dans un congrès mnhn-03632957v1
Image document

De Delta à Omicron, scénarios de tendances hospitalières pour l'hiver 2021-2022

Samuel Alizon , Mircea T Sofonea
[Rapport de recherche] 16, CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique; IRD - Institut de recherche pour le developpement; Université de Montpellier. 2021
Rapport hal-03502127v1
Image document

Characterization of Iron Acquisition and Iron Storage Mechanisms in the diatom Phaeodactylum tricornutum

Xia Gao
Subcellular Processes [q-bio.SC]. Université Paris-Saclay, 2021. English. ⟨NNT : 2021UPASB037⟩
Thèse tel-03741828v1

The Sequential Loss of Allelic Diversity

Guillaume Achaz , Amaury Lambert , Emmanuel Schertzer
Advances in Applied Probability, 2018, 50 (A), pp.13--29. ⟨10.1017/apr.2018.67⟩
Article dans une revue hal-03848021v1

The fitness cost of mis-splicing is the main determinant of alternative splicing patterns

Baptiste Saudemont , Alexandra Popa , Joanna Parmley , Vincent Rocher , Corinne Blugeon , et al.
Genome Biology, 2017, 18 (1), ⟨10.1186/s13059-017-1344-6⟩
Article dans une revue hal-02321589v1
Image document

Inferring epidemiological parameters from phylogenies using regression-ABC: a comparative study

Emma Saulnier , Olivier Gascuel , Samuel Alizon
PLoS Computational Biology, 2017, 13 (3), pp.e1005416. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005416⟩
Article dans une revue hal-01567904v1
Image document

Memory is key in capturing COVID-19 epidemiological dynamics

Mircea T Sofonea , Bastien Reyné , Baptiste Elie , Ramsès Djidjou-Demasse , Christian Selinger , et al.
Epidemics, 2021, 35, pp.100459. ⟨10.1016/j.epidem.2021.100459⟩
Article dans une revue hal-03289624v1

Clade diversification dynamics and the biotic and abiotic controls of speciation and extinction rates

R. Aguilée , Fanny Gascuel , Amaury Lambert , Regis Ferriere
Nature Communications, 2018, 9, pp.3013. ⟨10.1038/s41467-018-05419-7⟩
Article dans une revue hal-02541250v1

Characterization of a Xenopus tropicalis Endogenous Retrovirus with Developmental and Stress-Dependent Expression

L. Sinzelle , Quentin Carradec , E. Paillard , O. Bronchain , Nicolas Pollet
Journal of Virology, 2011, 85 (5), pp.2167-2179. ⟨10.1128/JVI.01979-10⟩
Article dans une revue hal-02341751v1
Image document

Epithelial stratification shapes infection dynamics

Carmen Lia Murall , Robert Jackson , Ingeborg Zehbe , Nathalie Boulle , Michel Segondy , et al.
PLoS Computational Biology, 2019, 15 (1), pp.e1006646. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006646⟩
Article dans une revue hal-02069914v1
Image document

Limites et délais dans l’estimation du nombre de reproduction

Samuel Alizon , Bastien Reyné , Mircea T Sofonea
[Rapport de recherche] 5, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport hal-02882697v1

How ecology and landscape dynamics shape phylogenetic trees

F. Gascuel , R. Ferrière , R. Aguilée , A. Lambert
Systematic Biology, 2015, 64 (4), pp.590-607. ⟨10.1093/sysbio/syv014⟩
Article dans une revue hal-01176270v1

Inclusive fitness theory and eusociality

Patrick Abbot , Jun Abe , John Alcock , Samuel Alizon , Joao a C Alpedrinha , et al.
Nature, 2011, 471 (7339), pp.E1-4. ⟨10.1038/nature09831⟩
Article dans une revue hal-01567932v1
Image document

MOLD, a novel software to compile accurate and reliable DNA diagnoses for taxonomic descriptions

A.E. Fedosov , Guillaume Achaz , Andrey Gontchar , Nicolas Puillandre
Molecular Ecology Resources, 2022, 5, pp.2038-2053. ⟨10.1111/1755-0998.13590⟩
Article dans une revue hal-03663253v1
Image document

Emerging dynamics from high-resolution spatial numerical epidemics

Olivier Thomine , Samuel Alizon , Corentin Boennec , Marc Barthelemy , Mircea T Sofonea
eLife, 2021, 10, ⟨10.7554/elife.71417⟩
Article dans une revue hal-03415297v1
Image document

Analyzing and Modeling the Spread of SARS-CoV-2 Omicron Lineages BA.1 and BA.2, France, September 2021–February 2022

Mircea Sofonea , Bénédicte Roquebert , Vincent Foulongne , David Morquin , Laura Verdurme , et al.
Emerging Infectious Diseases, 2022, 28 (7), pp.1355-1365. ⟨10.3201/eid2807.220033⟩
Article dans une revue hal-03714983v1

Évolution, écologie et pandémies

Samuel Alizon
Points Sciences, 2020, 2757887238
Ouvrages hal-03045497v1
Image document

Analyse de l’épidémie de COVID-19 en France et scénarios de contrôle

Samuel Alizon , Mircea T Sofonea
[Rapport de recherche] 9, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport hal-02950665v1
Image document

Les effets sexe spécifiques de COVID-19 en France et l’implication potentielle des déficits en G6PD

Yannis Michalakis , Mircea T Sofonea , Samuel Alizon
[Rapport de recherche] 11, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport hal-02950702v1
Image document

Coevolution of virulence and immunosuppression in multiple infections

Tsukushi Kamiya , Nicole Mideo , Samuel Alizon
Journal of Evolutionary Biology, 2018, 31 (7), pp.995 - 1005. ⟨10.1111/jeb.13280⟩
Article dans une revue hal-01898496v1
Image document

Toward community standards in the quest for orthologs

Christophe Dessimoz , Toni Gabaldon , David Roos , Erik L L Sonnhammer , Javier Herrero , et al.
Bioinformatics, 2012, 28 (6), pp.900-904. ⟨10.1093/bioinformatics/bts050⟩
Article dans une revue hal-01636872v1